宇宙世纪0071。卡斯瓦尔和阿尔蒂西亚失去了父亲吉恩·祖姆·戴昆（Side 3 Munzo 自治共和国的主席），与父亲的亲密助手金巴·拉尔一起逃离了 Side 3。在地球上，他们以爱德华·马斯和赛拉·马斯的名字生活。与此同时，Side 3更名为吉翁自治共和国，副议长德格文·索多·扎比领导的扎比家族控制了国家。扎比家族已经追上了卡斯瓦尔和阿尔蒂西亚，并开始开发一种新武器“机动工人”，目标是地球联邦军...

宇宙世纪0068年，居住在SIDE3的慕佐自治共和国议长发表完《完全独立宣言》后意外身亡，由此引发了连番的动乱，许多人的命运也就此发生根本转变。转眼来到宇宙世纪0074年，爱德华·玛斯（池田秀一 配音）以夏亚·阿兹纳布的身份进入吉恩自治共和国国防军官学校学习。在那里，他与来自SIDE3的名门子弟格尔玛（柿原彻也 饰）互相赏识，成为模拟好友。 宇宙世纪0077年，学生们揭竿而起，发起了针对地球联邦军...